Европски вредности во творештвото на бугарските и македонските литературни творци во 20 век, 2014–2015, aкад. Милан Ѓурчинов, доц. Александар Јорданов (ИЛ).
Културната интеграција и стабилноста на Балканот, 2014–2016, акад. Катица Ќулавкова, проф. Милена Божикова (ИИИзк).
Одделение за општествени науки
Богомилското движење и богомилската книжевност, 2014–2016, акад. Блаже Ристовски, проф. д-р Маја Ангеловска-Панова, ИНИ, акад. Васил Ѓузелев (ИИОЗ).
Ослободителните движења на Македонија и на Бугарија и борбата на македонскиот и на бугарскиот народ за свои држави во XIX век до Младотурската револуција, 2014–2016, акад. Иван Катарџиев, проф. д-р Владо Поповски, проф. Светлозар Елдаров (ИБЦТ).
Процеси на модернизација на Балканот под османлиска власт во 19 век, 2014–2016, доп. член Драги Ѓоргиев, проф. Илија Тодев (директор ИИИ).
Православието и католицизмот на Балканот во ХІХ–ХХІ век, 2014–2016, акад. Иван Катарџиев, проф. д-р Далибор Јовановски, Филозофски факултет, проф. Светлозар Елдоров (ИБЦТ).
Современи проекции на културните традиции и европската перспектива; етнолошки, фолклорни и етномузиколошки аспекти, 2014–2016, акад. Блаже Ристовски, проф. Танас Вражиновски, проф. Лозанка Пејчева (директор ИЕФЕМ).
Интеграција и оптимизација на регионалната инфраструктура, 2014–2016, акад. Абдулменаф Беџети, проф. Митко Димитров (ИИкном.Изсл.).
Импликациите од европската должничка криза врз процесите на економската интеграција во Европската унија, 2014–2016, акад. Таки Фити, проф. Митко Димитров (ИИкон.И).
Забрзување на економскиот раст, инвестициите и економската соработка, 2014– 2016, акад. Гоце Петрески, проф. Татјана Хубенова (ИИкон.Изсл.).
Реформи во судството, 2014–2016, aкад. Владо Камбовски, доц. Маргарит Ганев (ИДП).
Регионалната соработка и развој во процесот на европската интеграција: имплементирање на добрите ЕУ-практики во ЈИЕ, 2014–2016, акад. Владо Камбовски, д-р Румјана Желева (ИИОЗ) / (ИДП).
Од паганство до христијанство – ритуал и уметност, 2014–2016, акад. Вера Битракова Грозданова, проф. д-р Јулија Вaлева.
Уметноста во 19 век – Дебарската и Самоковската школа, 2014–2016, акад. Цветан Грозданов, проф. Иванка Гергова (ИИИзк).
Одделение за медицински науки
Интегрирана имуногенетска анализа на молeкуларни маркери на карциномот на мочниот меур релевантни во проценката на рекурентноста и прогресијата на болеста, 2014–2016, акад. Живко Попов, акад. Дамјан Дамјанов (БАН) и чл.кор. Чавдар Славов.
Балканска ендемска нефропатија, 2014–2016, акад.Момир Поленаковиќ, проф. д-р Дијана Плашеска-Каранфилска, акад. Ангел Г’лабов, проф. Драга Тончева.
Одделение за природни, математички и биотехнички науки
Статистичко моделирање и статистичко учење: примена и развој, 2014–2016, акад. Дончо Димовски, д-р Жанета Попеска, ФИНКИ, проф. Евгенија Стоименова (ИМИ).
Ученички институт по математика и информатика, 2014–2016, акад. Дончо Димовски, чл.-кор. Олег Мушкаров (ИМИ).
Примена на атомска апсорпциона спектрометрија за анализа на елементи во траги, 2014–2016, акад. Глигор Јовановски, проф. д-р Трајче Стафилов, ПМФ, проф. Димитар Цалев, ФСФ, Софиски универзитет Св. Климент Охридски.
Спектроскопски и структурни истражувања на некои метални комплекси, 2014–2016, акад. Бојан Шоптрајанов, проф. Виктор Стефов, ПМФ, проф. Виолета Колева, Институт за општа и неорганска хемија, БАН.
Тавтомерни рамнотежи кај молекуларни кластери и течности, 2014–2016, акад. Бојан Шоптрајанов, проф. д-р Љупчо Пејов, ПМФ, проф. д-р Венелин Енчев (ИОХЦФ).
Изучување на површинската морфологија на наноструктурни тенки слоеви со техники на микроскопиja со скенирачка сонда, 2014–2016, акад. Глигор Јовановски, доц. д-р Билјана Пејова, ПМФ доц. д-р Ирина Бинева (ИФТТ).
Структурна карактеризација и изучување на електрични и каталитички својства на новосинтезирани комплексни перовскити, 2014–2016, акад. Бојан Шоптрајанов, проф. д-р Слободка Алексовска, ПМФ, проф. д-р Даниела Ковачева (ИОНХ).
Приготвување и карактеризација на електрохромни тенки филмови од ванадиумови оксиди, 2014–2016, акад. Глигор Јовановски, проф. д-р Методија Најдоски, ПМФ, проф. д-р Виолета Колева, Институт за општа и неорганска хемија, БАН.
Синтеза, карактеризација и антимикробна евалуација на некои нови хинолони, 2014–2016, акад. Глигор Јовановски, проф. д-р Емил Поповски, ПМФ, доц. Божана Михова (ИОХЦФ).
Зафаќање на полнеж во структури метал/оксид/highk диелек трик/оксид/Si (MOHOS) за примени во трајни мемории, 2014–2016, акад. Бојан Шоптрајанов, проф. д-р Ненад Новковски, ПМФ, вонр. проф. д-р Албена Паскалева, (ИФТТ).
Флористички и таксономски истражувања на некои родови од фамилиите Lamiaceae и Asteraceae во Република Македонија и во Република Бугарија, 2014–2016, акад. Владо Матевски доц. д-р Светлана Банчева (ИБЕИ).
Одделение за технички науки
Синхронизирана работа на нуклеарна централа со реверзибилна хидроцентрала, 2014–2016, акад. Томе Бошевски, проф. д-р Антон Чаушевски, доц. Павлин Грудев (ИЈИЈЕ).
Анализа на ползите и барањата за користење на нови поколенија нуклеарни реактори во Република Бугарија и во Република Македонија, 2014–2016, акад. Томе Бошевски проф. д-р Никола Попов, доц. Павлин Грудев (Институт за нуклеарни истражувања и нуклеарна енергија – ИЈИЈЕ).
Развој на методи за стратешки планирања на енергетиката, 2014–2016, акад. Глигор Каневче, проф. Пламен Цветанов (ИЈИЈЕ).
Испитување на комуникациите за хетерогени безжични мрежи, 2014–2016, акад. Љупчо Коцарев, доц. Игор Мишковски, доц. Румен Андреев (ИИКТ).
Бугарско-македонска научно-иновациска соработка: балкански и европски перспективи, 2014–2016, акад. Љупчо Коцарев, проф. Росица Чобанова (Екон.истр.).